ビルドすると以下の様なエラーが発生してしまいました。
java.lang.AssertionError: Assert failed: Cycle detected on node type editor.collection/CollectionNode and output :build-targets
(not (contains? (:in-production evaluation-context) [node-id label]))
調べてみると特定のcollection ファイルでエラーが出ている事が分かりました。設定項目をひとつずつ確認していくと…

gui_script ファイルを割り当てなければいけない場所に、なぜかcollection ファイルが割り当てられていました。何かの拍子にミスをしていたみたいです。こちらをgui_script へ再設定したところエラーは消えました。